WEYIPNV是SurA的配体,特异性与SurA的P1结构域结合(Kd:1-14μM)。WEYIPNV的结合促进了P1结构域从核心结构域的释放。
分子量:920.02
分子式:C45H61N9O12
CAS 号:652969-14-7
三字母:Trp-Glu-Tyr-Ile-Pro-Asn-Val
单字母:WEYIPNV
周质分子伴侣SurA在外膜蛋白(OMP)的生物合成过程中发挥着关键作用。大肠杆菌SurA由一个核心结构域和两个肽基脯氨酰异构酶结构域(P1和P2)组成,但其客户结合机制和分子伴侣功能一直不清楚。在此,我们利用化学交联、氢氘交换质谱、单分子荧光共振能量转移和分子动力学模拟来绘制SurA上的客户结合位点,并探究构象动力学在外膜蛋白识别中的作用。我们证明,SurA在溶液中呈现出一系列构象,在这些构象中,P2主要靠近核心/P1结构域,比SurA晶体结构所显示的更近。外膜蛋白结合位点主要位于核心结构域,外膜蛋白结合会导致核心/P1结构域之间的构象变化。综合来看,结果表明未折叠的外膜蛋白底物结合在由SurA结构域形成的“摇篮”中,结构域之间的结构灵活性有助于外膜蛋白的识别、结合和释放。
参考文献:DOI: 10.1038/s41467-020-15702-1