Pardaxin P 4 是一种存在于红海鲽鱼 (Red Sea Moses sole) 分泌物中的抗菌肽。Pardaxin P 4 作为生物膜的穿孔剂,能够与不同组成的磷脂双层膜相互作用,并诱导细胞毒性与孔形成。Pardaxin P 4 可用于抗菌药物的研究。
Pardaxin是一种属于α-螺旋、成孔肽家族的鱼类毒素,常用于毒理学和生物物理学研究中以探究毒素与细胞及脂质人工膜的相互作用。
单字母 H2N-GFFALIPKIISSPLFKTLLSAVGSALSSSGGQE-OH
多字母 H2N-Gly-Phe-Phe-Ala-Leu-Ile-Pro-Lys-Ile-Ile-Ser-Ser-Pro-Leu-Phe-Lys-Thr-Leu-Leu-Ser-Ala-Val-Gly-Ser-Ala-Leu-Ser-Ser-Ser-Gly-Gly-Gln-Glu-OH
氨基酸个数 33
分子式 C154H248N36O45
平均分子量(MW) 3323.83
CAS号:134940-98-0
本研究采用比色法磷脂/聚二乙炔仿生检测法,对两种pardaxin类似物的膜相互作用进行了分析。该检测中,聚二乙炔通过pardaxin与囊泡膜的相互作用发生可见光谱、浓度依赖性的蓝红光转换。Pardaxin P4和P5均由33个氨基酸组成,但在羧基末端存在单氨基酸替换(分别为G31至D31),已知该替换会降低成孔活性。比色法检测中加入pardaxin后可诱导剂量依赖性颜色转变,且呈现不同动力学特征。比色分析能区分不同pardaxin的膜相互作用模式,提示P4与双层膜表面结合,而P5则穿透囊泡膜。尽管囊泡相互作用pardaxin的圆二色谱未显示这两种毒素类似物在二级结构上存在显著差异,比色法仍可有效区分pardaxin的膜相互作用特征。本研究采用的比色测定平台是一种实用检测方法,可广泛应用于肽类物质(尤其是成孔毒素)的膜相互作用研究,并有望成为评估毒素结构-活性定量关系的重要工具。
Pardaxin P4与P5的剂量-反应曲线存在显著差异(图B),这提示二者可能通过不同机制与膜发生相互作用。动力学特征的差异进一步揭示了这些多肽与膜相互作用的特性。Magainin表现出极快的颜色转变,这与其作为两亲性肽在双层膜中的强附着特性相关。Pardaxin的CR值缓慢上升则归因于双层膜内协同作用过程较慢,这很可能与孔道组织过程有关[15]。P4相较于P5更快的转变速率可能与其多肽在双层膜表面的定位有关(这一现象在图2B的剂量-反应曲线中亦清晰可见)。从原理上讲,较高的CR%与双层膜表面结合存在直接关联,因为此类相互作用会显著提升相邻聚二乙炔基质中侧链的迁移率。
参考文献:DOI: 10.1016/j.peptides.2008.05.012